Rares sont les personnes qui connaissent son existence. Mais quand des millions de vies sont en jeu, il intervient : Sam Fisher, l'agent spécial du Troisième Echelon, une unité ultra secrète de la CIA, se charge des missions trop délicates ou trop risquées pour les agents ordinaires. Et il opère seul. L'un des plus anciens amis de Sam Fisher est assassiné. Il a été empoisonné et on découvre des traces de radiations sur le corps. Les recherches de Fisher le mènent à un poison tellement dangereux que très peu de pays sont capables de le produire. En remontant la piste, Sam se retrouve au Kirghizistan. Il va tenter de mettre fin aux activités d'un terroriste islamiste qui cherche à détruire le monde moderne en s'attaquant à l'un de ses piliers les plus fragiles : le pétrole.